研究方向

主要研究方向為外周組織振蕩器的生物鐘基因在生理節律不同階段的特定表達；免疫生理節奏的分子機制；研究生物鐘基因mPer2如何調節學(xué)習和記憶行為。

發(fā)現哺乳動(dòng)物關(guān)鍵的生物鐘基因—mPer1和mPer2，該發(fā)現揭示了哺乳動(dòng)物生物鐘的分子生物學(xué)基礎，曾經(jīng)被《Science》評為1997年度十大科學(xué)突破。到目前為止，發(fā)表的十三篇生物學(xué)方面的研究論文，被他人引用了1400多次。近幾年開(kāi)始從事表觀(guān)基因組學(xué)研究，成功預測了基因組上所有的DNA甲基化功能區序列，運用自主研發(fā)的9K CGI芯片對惡性腫瘤、出生缺陷等疾病進(jìn)行了大規模的DNA甲基化修飾研究，并且運用9K CGI芯片和bisulfite測序對不同的甲基化DNA富集技術(shù)進(jìn)行了系統的評價(jià)。

研究領(lǐng)域

基因組學(xué)、表觀(guān)基因組學(xué)、行為遺傳學(xué)

1.疾病及生命現象的基因組及表觀(guān)基因組研究。本研究的長(cháng)期目標是利用基因組學(xué)手段揭示控制生物學(xué)表型的遺傳及表觀(guān)遺傳代碼。首先發(fā)展全基因組水平的表觀(guān)遺傳密碼的分析技術(shù)，包括基于新一代測序儀的全基因組DNA甲基化譜圖的分析方法及組蛋白修飾分析方法。隨后，利用此項技術(shù)在全基因組上分析復雜生物現象、疾病與DNA甲基化及組蛋白修飾的關(guān)系。此外，還將開(kāi)發(fā)基于新一代測序儀的全外顯子組測序技術(shù)，并利用此技術(shù)在全基因組水平上分析孤獨癥等復雜疾病與基因突變的關(guān)系。

2.疾病及生命現象的生物鐘調控機制研究。在基因組、細胞及行為學(xué)水平上分析免疫與生物鐘、心血管疾病與生物鐘、藥物成癮與生物鐘、疼痛與時(shí)間生物學(xué)的關(guān)系，了解受節律基因控制的相關(guān)生理過(guò)程的生物鐘調控機制。此外，我們認為生理節律除了受生物鐘基因的調控，還與組蛋白構型的24小時(shí)節律相關(guān)，因此，我們試圖揭示二者之間的關(guān)系。

3.表觀(guān)基因組分析算法及工具的開(kāi)發(fā)。人類(lèi)基因組中大部分的DNA甲基化發(fā)生在重復序列（repetitive genomic sequences）區，這些區域的DNA甲基化在維持基因組穩定性過(guò)程中發(fā)揮著(zhù)至關(guān)重要的作用，并可能影響了惡性腫瘤的發(fā)生發(fā)展。但是目前單堿基分辨率的DNA甲基化分析方法所產(chǎn)生的短序列在重復序列區的比對、定位上存在重大缺陷，我們擬在前期已成功開(kāi)發(fā)甲基化可視化軟件iMethy的基礎上，進(jìn)一步開(kāi)發(fā)重復序列區DNA甲基化的分析算法和工具，提高甲基化修飾堿基的辨識率，為腫瘤基因組穩定性研究提供技術(shù)支撐。